Leveransen har skett från luften, då väpnade grupper som tros ha anknytning till terrorrörelser som IS och al-Qaida kontrollerar orten Farabougous omgivning.
Dessutom har regnväder gjort att framkomligheten på marken är begränsad.
Mali meddelar att transportplan "genomfört en betydande humanitär insats". En av ortens 2 000 invånare säger dock till Reuters att leveransen med säd och matolja inte är tillräckligt för att föda befolkningen.
– Vi är fortfarande belägrade. Ingen kommer in eller ut.
Militanta extremister har ofta ställt sig på folkgruppen fulanis sida i lokala konflikter mellan fulani och bambara. Majoriteten av invånarna i Farabougou tillhör gruppen bambara.