Gripandet satte punkt för en 17 dagar lång jakt som tog vid efter att 33-åringen avvikit från sin husarrest i Sydney.
Baluch misstänks ha försökt smuggla in 900 kilo kokain till ett värde av nära 200 miljoner dollar i landet. Lasten upptäcktes på ett fartyg från Ecuador.
Gripandet skedde sedan Baluch påträffats gömd i en bil som transporterades på en långtradare.
Han greps ursprungligen i juni, men släpptes den 22 oktober mot borgen och försågs med fotboja. Tre dagar senare lyckades han ta sig ur fotbojan och rymma från sitt exklusiva hem.
"Det här är vår Pablo Escobar", sade Dave Elliot, polischef i delstaten New South Wales, till en lokalradiostation i oktober. Detta med hänvisning till den colombianske drogbaronen och ledaren för Medellínkartellen.
Polisen misstänker enligt Elliot att Baluch är medlem i en internationell narkotikakartell av "aldrig tidigare skådat slag".