Anledningen är, enligt presidenten, att belarusiska myndigheter har avslöjat hemliga terrorceller med planer på att kuppa bort honom från makten.
– De har gått över gränsen. Vi kan inte förlåta dem, säger Lukasjenko under ett tal inför lördagens nationaldagsfirande.
Enligt Lukasjenko har grupperna kopplingar till Tyskland, Ukraina, USA, Polen och Litauen. Han kallar det för en "storskalig insats mot terrorism" och säger att gränsen stängs för att stoppa "flödet av vapen" till kuppmakarna.
Oleh Nikolaenko, talesperson för Ukrainas utrikesdepartement, tillbakavisar anklagelserna.
– Den ukrainska sidan har inte tagit emot något officiellt meddelande från Belarus om att gränsen ska stängas. De som skulle drabbas hårdast av en sådan handling vore det belarusiska folket, säger han.
Belarus och Lukasjenkos relation till omvärlden har länge varit ansträngd och den försämrades ännu mer efter nedtvingandet i maj av ett Ryanairplan och det efterföljande gripandet av regimkritikern Roman Protasevitj och hans flickvän Sofia Sapega.