Den gripne, en man in 40-årsåldern, är bror till den man som tidigare har gripits. De båda nekar till brott.
Den brittiske journalisten Dom Phillips och den brasilianske urfolksexperten Bruno Pereira har varit försvunna i Amazonas sedan den 5 juni.
Man har hittat en del av deras tillhörigheter, men polisen tillbakavisar påståenden om att de båda männens kroppar har påträffats. I måndags sade Brasiliens president Jair Bolsonaro att mänskliga kvarlevor hade hittats i samband med sökandet.