Den misstänkte gärningspersonen, som är en 16-årig pojke, attackerade de två skolorna på fredagsmorgonen. Det rör sig om en offentlig och en privat skola som ligger på samma gata, och 16-åringen är en tidigare elev på en av skolorna.
Bland dödsoffren finns två lärare och en elev. Sex av de skadade, varav två barn, vårdades fortfarande på sjukhus på fredagseftermiddagen.
Gärningsmannen var försedd med pistol och iklädd skottsäker väst. Den misstänkta försökte fly men kunde gripas av polis fyra timmar senare.
"Vi kommer att fortsätta att utreda motivet och borde ha mer information inom en snar framtid", skriver Renato Casagrande, guvernör i delstaten Espírito Santo.
Den tillträdande presidenten Lula da Silva kallar händelsen för en "absurd tragedi", och uttrycker sina sympatier med offrens familjer.
Den här typen av brott är relativt ovanliga i Brasilien. Den dödligaste skolskjutningen inträffade 2011 och krävde elva barns liv.