De två filippinska journalisterna dömdes i juni till fängelse i vad som tolkats som ett sätt att tysta deras rapportering.
"Vi är oroliga att domen sänder ett starkt budskap till journalister om att kritisk rapportering medför risk att fängslas", heter det i brevet, som bland annat undertecknats av Alice Bah Kuhnke (MP).
Utöver förtalsdomen har filippinska myndigheter startat ytterligare utredningar mot journalisterna, som låg bakom den regeringskritiska nyhetssajten Rappler. Enligt brevet riskerar Maria Ressa nu nästan 100 år i fängelse.
I brevet uppmanas presidenten att lägga ner undersökningarna, att inte stoppa journalisternas överklagan av domen, och att garantera en fri och självständig press i landet.
Domen har tidigare kritiserats av bland annat EU:s utrikeschef, människorättsorganisationen Human Rights Watch och FN.