Minst 35 människor dödades i de separata dåden, som islamistiska extremister sägs ligga bakom.
En av attackerna riktades mot en boskapsmarknad i staden Kompienbiga i östra Burkina Faso, uppger vittnen och lokala myndigheter. Mellan 25 och 30 människor mördades. Angriparna kom till staden på motorcyklar och sköt sedan mot flyende invånare.
I den andra attacken utsattes en kolonn för ett bakhåll. Tio personer, fem civila och fem militärer, sköts ihjäl vid bakhållet som skedde i närheten av staden Barsalogho i norr.
Attackerna inträffade på lördagen.
De senaste fem åren har hundratals människor dödat i extremistdåd i det västafrikanska landet.