Gudkov greps i tisdags och hans lantställe utanför Moskva genomsöktes. Enligt myndigheterna berodde det på grund av en obetald hyresskuld. Även flera personer som står Gudkov nära och släktingar till honom fick sina hem genomsökta.
Han är fortfarande misstänkt i utredningen, rapporterar den ryska nyhetsbyrån Interfax.
Frisläppandet av Gudkov skedde dagen efter en domstol beslutade att en annan regimkritiker, Andrej Pivovarov, ska vara kvar i häkte i två månader i väntan på rättegång.
Pivovarov greps i måndags på ett flygplan på väg att lyfta från S:t Petersburg.