Beskedet kommer efter det att ryska myndigheter förra månaden beslutade att klassa Vtimes som "utländsk agent" – en beteckning som används på utlandsfinansierade organisationer som anses ägna sig åt politisk verksamhet.
Märkningen har skrämt bort sajtens samarbetspartners och gjort det svårare att ägna sig åt nyhetsverksamhet, enligt Vtimes ledning, som även motsätter sig beskrivningen av sajten som en politisk publikation.
Flera olika alternativ för att fortsätta publicera tidningen har övervägts, men ledningen kom fram till att medarbetarna nu riskerar att bli åtalade för brott och till och med dömas till fängelse.
Vtimes brukar beskrivas som ett av de sista oberoende medierna i Ryssland.
Sajten, som är registrerad i Nederländerna, startades av en grupp journalister som tidigare arbetat vid den respekterade affärstidningen Vedomosti. De lämnade Vedomosti efter det att en ny, Putinvänlig chefredaktör utsetts.
Även en annan populär rysk nyhetssajt, Meduza, blev nyligen dubbad "utländsk agent". För att kunna fortsätta verka trots förlorade annonsintäkter har Meduza startat en crowdfunding-kampanj.