En utredning har inletts för att försöka slå fast vilka som är ansvariga.
Attacker mot säkerhetsstyrkor och civila har ökat de senaste månaderna i landet, framför allt i regioner som gränsar till Mali och Niger som haft stora problem med jihadistgrupper.
Burkina Faso, ett av världens fattigaste länder, har upplevt två statskupper i närtid där militär tagit makten.
Sedan 2015 har det västafrikanska landet plågats av jihadistgrupper med kopplingar till al-Qaida och Islamiska staten. Tiotusentals människor har dödats och omkring två miljoner människor tvingats fly.