Ländernas militärer strider sida vid sida mot de jihadistiska grupperingar som bedriver uppror över flera gränser i Sahelregionen.
Under de senaste två veckorna har 20 misstänkta jihadister gripits och det har gjorts stora beslag, enligt de militära uppgifterna.
Minst 13 soldater har också dödats och sju skadats.
Myndigheternas besked följer på flera veckors protester i Burkina Faso, där många ifrågasatt hur framgångsrik landets armé är i dessa strider. Jihadisterna är kopplade till terrorrörelserna Al Qaida och IS.