Attacken inträffade i fredags, och ytterligare "43 nya kroppar hittades", meddelar militären i ett uttalande på måndagen. Därmed är dödssiffran över 50.
Burkina Faso är ett av världens fattigaste länder och härjas sedan 2015 av ett uppror lett av jihadister med koppling till terrorgrupperna IS och al-Qaida.
Antalet som dödats i oroligheterna är svårt att beräkna. Däremot beräknas två miljoner ha tvingats fly sina hem då drygt en tredjedel av landets territorium inte längre kan kontrolleras av regimen i Ouagadougou.
Landet har dessutom genomgått två militärkupper nyligen. Den senaste var i höstas när den 34-årige kaptenen Ibrahim Traoré tog makten.