Ytterligare två personer saknas, meddelar myndigheterna.
Översvämningarna överraskade gruvarbetarna i Abriaquí i departementet Antioquíam, uppger borgmästaren Héctor Urrego i en lokal tv-sändning.
– Killarna satt vid middagen, en del av dem tänkte vila, andra var på väg från jobbet när översvämningen kom, säger han.
På grund av det dåliga vädret har insatserna för att hitta dem som saknats skjutits upp till fredagsmorgonen.
20 familjer har evakuerats från en stad i närheten på grund av risk för ytterligare översvämningar.
Några timmar före översvämningen i Abriaquí omkom en kvinna i ett jordskred som orsakats av kraftiga regn i grannstaden Barbosa.