Han fördömer händelsen som han beskriver som ett terrordåd, och uppger att man misstänker att vänstergerillagruppen ELN ligger bakom dådet.
Två personer förklädda till tjänstemän körde in på basen i en vit skåpbil, där två explosioner sedan ska ha utlösts.
Colombias president Ivan Duque uppgav på Twitter att han omedelbart reste till platsen.
Basen används av en armébrigad och ligger nära gränsen till Venezuela.
Enligt militära källorna finns både militär personal och civila bland de skadade. En person uppger att antalet drabbade hade varit högre om inte de flesta i personalen varit isolerade till följd av pandemirestriktioner.
2019 avbröt Duque fredsförhandlingarna med ELN, till följd av en bilbombsattack i Bogotá där 22 kadetter dödades.