Till de drabbade hör det danska försvarsministeriet, den danska militära underrättelsetjänsten och den danska försvarsmakten.
Försvarsministeriet vill inte ge några kommentarer, men försvarsmakten uppger för nyhetsbyrån Ritzau att orsaken är tekniskt underhåll.
Förra veckan meddelade Försvarsmakten i Sverige att man drabbats av en attack som ledde till att webbplatsen var otillgänglig under tio minuter.