Journalisten greps tillsammans med flera aktivister i juni 2019, varav två av aktivisterna ska ha varit ledande vid ett större uppror i landet under den arabiska våren 2011. Samtliga anklagades för att ha planerat att begå terrorbrott tillsammans med det i Egypten förbjudna Muslimska brödraskapet. Journalisten och en av aktivisterna dömdes till fyra års fängelse.
Forskaren från Österrike som också benådades på lördagen, dömdes i fjol till fyra års fängelse för att ha spridit falska nyheter.
Frisläppandet av fångarna är en del av de åtgärder som presidenten kommit fram till i dialog med oppositionspartier och regeringskritiker. En annan orsak är att man vill förbättra landets image inför FN:s nästa klimattoppmöte som hålls i Egypten i november.