Det innebär en tredje mandatperiod och sex år till på posten för den 82-årige presidenten.
Den främsta rivalen, Cellou Dalein Diallo, som ifrågasatt det tidigare preliminära valresultatet, får 33,5 procent av rösterna och har utropat sig själv som segrare.
Vid offentliggörandet av valresultatet uppger vittnen att många poliser syntes på huvudstaden Conakrys gator sedan flera människor mist livet i oroligheter efter valet.
Tidigare har presidenter bara fått sitta två mandatperioder i landet, men det ändrades i våras, då en ny konstitution antogs.