Sju ministrar har blivit av med sina jobb. Samtliga tillhör landets centerparti, som är det mindre partiet i landets koalitionsregering.
Begäran gjordes av statsminister Kaja Kallas, tillhörande estniska reformpartiet, och godkändes av landets president under fredagen.
Anledningen ska vara flera veckor av politiskt dödläge. Bland annat skedde en votering om en utbildningsproposition där koalitionspartern röstade emot regeringen och med det högerextrema oppositionspartiet Ekre i stället.
Landet har även den högsta inflationen inom eurozonen – 19 procent.
Kallas efterfrågar nu nya samtal om ett regeringsbyggande och uppmanar till enighet på grund av säkerhetsoro med grannlandet Ryssland.
I landets parlament med 101 platser har Reformpartiet 34 ledamöter och Centerpartiet 25.
Estniska reformpartiet har föreslagit en koalition med högerkonservativa Isamaa och Socialdemokraterna. Under de nästan tre decennierna sedan Estland förklarade sig självständigt från Sovjetunionen har Centerpartiet och Reformpartiet alternerat i regeringsställning i landet.
Åtta ministrar återstår nu i regeringen. Tills en ny koalition bildas kommer de att ta över även övriga portföljer.