Enligt Nordirlandsprotokollet ska handeln mellan Storbritannien och Nordirland kontrolleras, så att varor inte kan flöda fritt in i och ut ur EU över gränsen mellan Nordirland och Irland.
Men trots att Europaparlamentet upprepade gånger uppmanat Storbritannien att följa protokollet har så inte skett, skriver EU-kommissionen i ett uttalande.
Kommissionen uppger sig ha avstått att tidigare inleda vissa rättsliga åtgärder "i en anda av konstruktivt samarbete".