Fördelarna med vaccinen överväger dock riskerna med stor marginal betonar EMA, som ändå anser att hjärtsyndromen bör listas som möjliga, men mycket ovanliga, biverkningar av vaccinen.
Hjärtsyndromen inträffar oftast två veckor efter andra dosen, enligt EMA, och drabbar främst yngre män. USA:s smittskyddsmyndighet har tidigare varnat för samma biverkningar.
Vaccinen från Pfizer-Biontech samt Moderna är så kallade mRNA-vaccin.
Även Världshälsoorganisationen WHO bekräftar på fredagen att det finns en "trolig koppling" mellan mRNA-vaccinen och "mycket sällsynta" inflammationer i hjärtat. Rapporter om biverkningar på hjärtat har kommit från flera länder. Hjärtmuskel- och hjärtsäcksinflammationer behandlas ofta med antiinflammatoriska läkemedel, och vid behov med syrgas.
WHO betonar också att vaccinen förebygger allvarlig covidsjukdom, sjukhusvistelse och död.