Över 280 flyg till och från Manila har ställts in, dirigerats om eller försenats, samtidigt som många människor försöker återvända hem efter jul och nyår.
Omkring 56 000 resenärer påverkas. Kaotiska scener har utspelat sig vid incheckningsdiskar när människor försökt att boka om biljetter eller få information om när deras plan kan tänkas lyfta.
Andra som har fått gå ombord innan felet uppstod har fått vänta i timmar innan de beordrats att lämna planet.
Ett tekniskt fel uppges ligga bakom problemet. Det var delvis åtgärdat vid fyra-tiden på eftermiddagen, lokal tid, och en del flyg kunde börja lyfta och landa i Manila.