Den 52-åriga kvinnliga spanskläraren attackerades under en lektion av en knivbeväpnad pojke som stormade rummet och låste dörren bakom sig. Trots försök att rädda lärarens liv avled hon av sina skador.
Den 16-årige förövaren, som var elev på skolan, har gripits.
Frankrikes utbildningsminister Pap Ndiaye säger att han är "extremt upprörd" efter det inträffade och att han kommer att åka till Saint-Jean-de-Luz.