Han blir därmed den första sittande franska justitieministern att åtalas, i ett fall som bedömare beskriver som genant för Macrons regering.
Dupond-Moretti, tidigare försvarsadvokat, anklagades i fjol för att ha missbrukat sin politiska position för att göra upp med motståndare från tiden som jurist. Han förnekar anklagelserna och har överklagat saken.
Även Macrons stabschef Alexis Kohler kommer att ställas inför rätta i ett annat fall rörande en intressekonflikt, enligt ett besked från en chefsåklagare.
Kohler anklagas för sina yrkes- och familjekopplingar till rederibolaget MSC, som drivs av hans mammas kusiner, uppger åklagaren.
Kohlers advokat uppger att hans klient nekar till anklagelserna.