Alla åtta personer ombord omkom. Bland lasten fanns tonvis av ammunition och kraschen följdes av minst två timmar av explosioner.
Planet, ett Sovjetbyggt Antonov An-12 som flögs av ett ukrainskt fraktbolag, var på väg från Serbien till Jordanien. Slutdestinationen var Bangladesh.
Det grekiska klagomålet handlar om att grekiska myndigheter inte på förhand fått någon information om vilken typ av last som funnits i planet, uppger en regeringskälla.