Enligt Kostas Genidounias, ordförande för fackförbundet OSE, är nattens olycka "ofattbar" och "hade kunnat undvikas om säkerhetssystemen hade fungerat", skriver AFP.
Enligt nyhetsbyrån NTB finns även uppgifter från fackförbundet om att det elektriska signalsystemet på sträckan ofta drabbas av fel.
Orsaken till olyckan är fortfarande okänd. Kollisionen skedde när persontåget precis lämnat en tunnel, och enligt den regionala guvernören befann sig då tågen på samma spår sedan flera kilometer tillbaka. Vid lunchtid på onsdagen kom beskedet att stinsen i Larissa har gripits, men det är ännu oklart vad 59-åringen anklagas för.
Över 35 människor har dödats och över 80 skadats vid olyckan, som skedde utanför staden Larissa i norra Grekland.