På bara tolv timmar har delar av Aten fått regn motsvarande två års nederbörd.
Regnet har i stort slutat falla, men på marken fortsätter problemen, främst i Thessalien i mellersta delen av landet.
Utanför staden Larissa har en flod svämmats över och skyddsvallar brustit. Flera bostadsområden har evakuerats och tusentals hus har översvämmats.
– Vattnet stig för varje minut, säger en av de drabbade, Ioanna Gana, till grekisk tv.
Vägar i området har svämmats över och i flera fall förstörts av lermassor eller stenras. Runt 300 personer har evakuerats med helikoptrar från byar i området, men ytterligare hundratals väntar på att kunna flygas ut.
Tv-bilder visar översvämmade gator i byarna, varav många saknar såväl elektricitet som rinnande vatten, och maten börjar även den ta slut.
I de områden som har kust mot Egeiska havet har runt 2 000 personer, såväl lokalbor som turister, evakuerats med båtar.
– Första prioritet de närmaste dagarna är att försäkra oss om att vi kan evakuera alla från farliga områden, säger premiärminister Kyriakos Mitsotakis och uppger att 15 helikoptrar deltar i räddningsarbetet.
Han säger också att han har bett om finansiellt stöd från EU för att klara av den återuppbyggnad som kommer att krävas.
