Dessutom förbjuds butiker, kaféer och barer att spela musik – dygnet runt.
Tanken bakom att förbjuda musik är att det blir lättare att hålla avstånd när människor inte måste böja sig mot varandra för att överrösta volymen. Grekland införde ett nationellt musikförbud i maj men det hävdes när smittonivåerna sjönk.
Mykonos mottar normalt över en miljon gäster varje år och är efter fjolårets stympade turistsäsong i desperat behov av besöksnäringens intäkter.
Borgmästaren Konstantinos Koukas kallar regeringens beslut orättvist och missriktat.
"Mykonos kan inte vara den enda ön där musik inte hörs. Det enda det här kommer att uppnå är att besökarna åker till en annan ö i stället", skriver han på Facebook.