Sandoval fick i fredags sparken från sin tjänst och sade då att han mött hinder i sitt arbete och att landets justitieminister Consuelo Porras förbjudit honom att utreda anklagelser mor president Alejandro Giammattei utan hennes uttryckliga stöd och att hans oberoende därmed hotades.
Sandoval lämnade på lördagen huvudstaden Guatemala City (Ciudad de Guatemala), och begav sig till grannlandet El Salvador.
– Det var för att skydda honom och rädda hans liv, säger människorättsföreträdaren och ombudsmannen Jordan Rodas till nyhetsbyrån Reuters.
Själv höll Sandoval en presskonferens innan han gav sig av och sade då:
– Jag är bara den senaste i en lång rad åklagare som har drabbats av konsekvenserna för att ha försökt komma fram till sanningen och nå rättvisa.
"Blev för effektiv"
Justitiedepartementet uppger å sin sida att Sandoval fick gå efter sitt "konstanta missbruk och frekventa överträdelser av" sina befogenheter, och att han försökt underminera justitieministerns "arbete, integritet och värdighet".
Avskedandet av Sandoval fick hundratals att på lördagskvällen demonstrera utanför presidentpalatset och flera av Guatemalas inflytelserika sammanslutningar av lantbrukare uppmanar sina medlemmar till strejk under måndagen.
Även USA kritiserar beslutet och hyllar Sandoval som en antikorruptionens förkämpe.
"Guatemalas justitieminister sparkade åklagaren Sandoval för att han blev för effektiv i kampen mot organiserad brottslighet och dess kopplingar till politiker", skriver Stephen McFarland, USA:s förre ambassadör i Guatemala, på Twitter.
Lovade kämpa mot korruptionen
Sandovals utredningskommission Feci startades i samarbete med den FN- och Sverigestödda internationella kommissionen mot straffrihet i Guatemala (Cicig), vars verksamhet av president Giammattei beskrivits som ett oacceptabelt intrång i Guatemalas suveränitet.
Giammatteis företrädare – korruptionsanklagade Jimmy Morales – kastade ut Cicig ur landet och Giammattei lovade innan han tillträdde i januari 2020 att ta itu med korruptionen i Guatemala.