Organisationen säger att det handlar om gänguppgörelser och att flera personer bränts levande.
"De flesta av de mördade kvinnorna och flickorna hade blivit våldtagna innan de dödades", uppger RNDDH.
Man har även funnit en massgrav med kvarlevor efter minst 30 personer.
Minst 9 000 invånare i de drabbade stadsdelarna har flytt sina hem och tagit sin tillflykt hos släktingar eller på tillfälliga platser, som kyrkor och skolor.
Även om våldet har avtagit något de senaste dagarna har de flesta av de människor som flytt ännu inte kunnat återvända till sina hem, då de fruktar att våldet ska återupptas.
Under flera decennier har beväpnade gäng härjat i de fattigaste stadsdelarna i Port-au-Prince, men de har drastiskt skärpt sitt grepp om staden och landet under de senaste åren, och i takt med detta har antalet mord och kidnappningar ökat.