Migranterna, de flesta från Vietnam, försökte ta sig från Belgien till Storbritannien.
"De mår bra men vissa hade symtom på hypotermi", sa belgiska myndigheter i ett uttalande.
Personerna ombord kunde räddas med helikopter och föras till kustpolisen i staden Zeebrygge i Belgien. Polisen meddelade att de kommer att inleda en utredning kring "den människosmugglande organisation som är ansvarig för händelsen".
Belgiska, franska och brittiska myndigheter har sedan tidigare känt till att ett hundratal vietnamesiska migranter vistats i ett läger i staden Grande-Synthe på Frankrikes norra kust, i väntan på att ta sig in i Belgien och därifrån försöka korsa sundet.
För människor från Vietnam som försöker ta sig till Storbritannien är den sista etappen på resan ofta den farligaste. I oktober förra året återfanns 39 vietnamesiska migranter kvävda till döds i en lastbil i östra London.
Efter den händelsen dömdes två personer för människosmuggling.