Branden som härjade i den gotiska medeltidskyrkan för två år sedan smälte cirka 300 ton blypaneler i taket, vilket ledde till att den giftiga metallen spreds i stora delar av staden.
Riskerna för exponering gjorde att flera områden och skolor i Paris fick stängas, samtidigt som blodprov på barn och gravida genomfördes för att se om de utsatts för höga halter av bly.
Delar av torget framför Notre-Dame kunde återöppnas några veckor efter branden med löfte om regelbunden provtagning.
"Den senaste tidens tester har visat onormalt höga koncentrationer av blydamm på delar av torget", säger Parispolisen i ett uttalande.
Torget väntas öppna igen efter att en ny saneringsomgång har genomförts.