Tidigare bedömdes smittspridningen vara begränsad till norra delarna av ön, främst huvudstaden Taipei.
– (Antalet smittade) fortsätter att öka i andra städer och regioner förutom Taipei, sade landets hälsominister Chen Shih-chung när han annonserade nya restriktioner.
Det blir bland annat obligatoriskt med munskydd. Som mest får fem personer nu samlas inomhus och tio personer utomhus.
Fallen av inhemsk smittspridning har ökat markant den senaste veckan. Tidigare under pandemin har Taiwan haft ett par hundra fall av inhemsk spridning totalt, nu är siffran uppe i 1 200 fall.
Hela ön har nu uppgraderats till en trea på en fyragradig skala. Nivå fyra skulle innebära att Taiwan stänger ner helt och inför utegångsförbud, förutom för att handla mat och köpa mediciner.