En del av dem protesterade i Barcelona på fredagen och rök ihop med polisen.
Ett 50-tal virusförnekare slängde tegelstenar och sköt fyrverkerier mot polisen i stadens centrum. Polisen nöjde sig med att driva bort demonstranterna.
Incidenten föregicks av en lugn demonstration med runt 700 deltagare längs en av huvudgatorna.
Snarlika tumult har uppstått vid virusförnekelser i Bilbao i norra Spanien samt i städer runt om i Italien.
Spanien, ett av de hårdast coronadrabbade länderna, återinförde nationellt nödläge i söndags med restriktioner som mycket ingående begränsar spanjorernas vardagsliv.