Med sig har Lee sin privata sekreterare, pressekreterare samt sin fru, enligt ett uttalande från regeringen.
Lee väntas träffa president Xi Jinping, och kommer också att presentera sin regering för att få den godkänd, skriver South China Morning Post.
Mötet blir det första mellan Lee och höga kinesiska ledare sedan Lee vann valet den 8 maj. Han var den ende kandidaten som tilläts av det kinesiska kommunistpartiet och vann med drygt 99 procent av rösterna.
I förra veckan godkände premiärminister Li Keqiang formellt utnämningen av Lee, genom att signera dokumentet som nu ska överräckas.
Lee ersätter Carrie Lam som Hongkongs chefsminister.