Minst 35 personer omkom i skred i Uttarakhand under tisdagen, och fem under måndagen, enligt delstatens myndigheter. De flesta dog i regionen Nainital där enorma och intensiva skyfall förstörde flera byggnader.
Fem av de döda kom från samma familj, de förolyckades när deras hus täcktes av jordmassor i ett skred.
Den meteorologiska myndigheten IMD har uppdaterat sin prognos från "kraftigt" till "väldigt kraftigt" regn i området de närmaste två dagarna.
Även landets södra delar har drabbats av omfattande oväder, IMD förutspår att mer regn väntas de närmaste dagarna. Minst 27 personer har omkommit i ovädren i delstaten Kerala.