Bland de döda finns flera barn, enligt IHR:s rapport.
Amnesty International anklagar Iran för att medvetet använda dödligt våld för att slå ned mot demonstranterna. Utan ett kollektivt internationellt ingripande riskerar ännu fler människor att dödas, fängslas, torteras och utsättas för sexuella övergrepp, uppger organisationen.
"De iranska myndigheterna har mobiliserat sitt väloljade maskineri av repression för att hänsynslöst slå ned mot landsomfattande protester i ett försök att krossa allt som utmanar dess makt", säger Amnesty i ett uttalande på fredagen.
Exakt vad som pågår i Iran är svårt att veta – regimen har strypt åtkomsten till internet på flera håll, och iranier fruktar att internationella samtal som förs på traditionella telefonlinjer avlyssnas.
IHR uppger att regimanknutna konton på meddelandeappen Telegram har delat filmklipp på påstådda erkännanden från demonstranter, vilket beskrivs som en flagrant kränkning av deras rättigheter. Enligt IHR har erkännanden tvingats fram under hot och tortyr.
Protesterna har sitt ursprung i 22-åriga Mahsa Zhina Aminis död i nordvästra Iran den 16 september. Amini greps för att hon enligt landets moralpolis inte bar sin huvudsjal på korrekt vis. Hon dog tre dagar senare under oklara former efter att ha förts från häkte till sjukhus.