Enligt en hemligstämplad rapport från organet som nyhetsbyrån AFP tagit del av uppskattas det totala anrikade uranet till över 4 400 kilo.
202,8 kilo anrikat uran var den övre gräns som bestämdes i kärnenergiavtalet JCPOA.
Överenskommelsen tecknades 2015 mellan å ena sidan Iran, å andra sidan de fem permanenta medlemmarna av FN:s säkerhetsråd samt EU och Tyskland. Iran gick då med på att begränsa sitt atomenergiprogram i utbyte mot hävda ekonomiska sanktioner.
IAEA kallar också Irans beslut att dra tillbaka ackrediteringen till flera inspektörer som bland annat "extremt" och att det "allvarligt påverkat" organets arbete.
"Irans hållning är inte bara utan motstycke, det strider också otvetydigt mot det samarbete som krävs", står det i rapporten.
2018 lämnade USA:s dåvarande president Donald Trump avtalet och sedan dess har det knakat rejält i fogarna. USA återinförde tuffa sanktioner mot landet, vilket har påverkat andra länders möjligheter att handla med Iran.