Enligt en statlig tv-kanal rör det sig hittills om över 20 personer.
Översvämningen sker sedan en flod svämmat över i närheten av staden Estahban till följd av kraftig nederbörd, enligt lokala myndigheter.
Videoupptagningar som publicerats på sociala medier visar bland annat fordon som svepts med vattenmassorna.
55 personer uppges ha räddats, men många personer saknas fortfarande.
Meteorologer hade varnat för eventuell kraftig nederbörd i hela landet som i åratal varit hårt drabbat av torka. Riskerna med översvämningar har också förvärrats på grund av det omfattande byggandet av såväl hus som vägar i närheten av floder.
I mars 2018 orsakade en annan översvämning i Farsprovinsen 44 människors död. I januari i år drabbades provinsen också av en översvämning som skördade åtminstone 8 människoliv.