Varningen fick myndigheterna att evakuera befolkningen i tre prefekturer för att förhindra en katastrof likt den i staden Atami för en vecka sedan.
Då orsakade intensivt regn ett jordskred i staden som ligger nio mil söder om Tokyo. Nio personer har bekräftats döda efter jordskredet, som svepte med sig flera hus. 20 personer saknas ännu.