– Vi har beslutat att möblera om bland vår personal och göra en omstart med våra säkerhetsuppgifter, och det är därför jag har lämnat in min avskedsansökan till den nationella säkerhetskommissionen i dag, säger Itaru Nakamura vid en presskonferens.
Shinzo Abe sköts till döds den 8 juli under ett kampanjmöte i regionen Nara. Den misstänkte mördaren greps på platsen.
Lokal polis i området har uppgett att det funnits "obestridbara" brister i säkerheten runt Abe.