Landet har under pandemin varit ett av världens mest slutna, med strikta kvoter för hur många människor som får passera gränsen. Åtgärderna har kritiserats som ineffektiva och ovetenskapliga, men har stort stöd hos befolkningen.
I mars kommer kvoterna att utökas så att fler studenter och arbetsresande får lov att komma in. Antalet höjs från 3 500 inresande om dagen till 5 000 och antalet dagar i karantän från sju till tre.
Vanliga turister kommer dock fortsatt stängas ute.
– Det är inte realistiskt att lätta på alla restriktioner på en gång, säger premiärminister Fumio Kishida vid en presskonferens.
Omikronsmittan bedöms ha passerat en topp i Japan de senaste veckorna. Den 5 februari registrerades 100 000 smittofall och de senaste dagarna har antalet snittat på drygt 90 000.