Utsläppet kommer att övervakas av representanter från den internationella atomenergiorganet IAEA och Tepcos personal ansvarar för att ta vattenprover och prover från fiskar.
Japans premiärminister Fumio Kishida gav det slutliga godkännandet för utsläpp på tisdagen vid ett möte med de ministrar som är inblandade i planerna. Han instruerade kärnkraftsoperatören Tepco att vara redo att inleda utsläppet på torsdagen, om väder och havsförhållanden så tillåter.
Japans regering hävdar att vattnet är renat och säkert. Internationella atomenergiorganet IAEA har också bedömt att utsläppet inte får nämnvärda negativa effekter för natur eller människor.
Ändå har planerna väckt starka protester, bland annat från fiskare i området som befarar att ingen kommer att våga köpa deras produkter.