Enligt en statlig kirgizisk utredningskommitté är det "fastställt" att mannen var inblandad i dådet. Det har inte meddelats några ytterligare uppgifter om honom.
39 människor dödades när en man kom till nattklubben Reina vid Bosporens strand i Istanbul och öppnade eld med ett automatvapen. Ytterligare 79 personer skadades.
Den 34-årige uzbekiske gärningsmannen dömdes förra året till livstids fängelse. Terrorrörelsen IS sade sig tidigt vara ansvarigt för dådet och hundratals människor greps av turkisk polis, utpekade som IS-anslutna.