Bussen tillhörde informations- och teknikdepartementet, uppger en departementsföreträdare.
Bombdådet sker samtidigt som företrädare för den afghanska regeringen, talibanerna, USA och Ryssland samlas i Moskva i ett försök att driva fredsprocessen framåt och minska våldet i Afghanistan.
Den afghanska regeringen har pekat ut talibanerna för ligga bakom en rad våldsdåd, bland annat mot regeringsanställda.
Talibanerna säger sig dock inte ligga bakom torsdagens bombattentat.