Beväpnade män, av myndigheterna kallade terrorister, besköt regeringssoldaterna nära gränsen mot Mali och Niger. Attacken inträffade i onsdags.
Burkina Faso skakas av jihadistiskt motiverat våld som har krävt över 1 200 dödsoffer de senaste åren. I början av oktober dödades runt 25 civila i ett bakhåll av beväpnade män i norra Burkina Faso, enligt FN.
Förra veckan drog valrörelsen i gång i landet inför president- och parlamentsvalet den 22 november och frågan om det jihadistiska våldet står högst på agendan. Våldet i landet tros stoppa invånare i nära 1 500 av Burkina Fasos omkring 8 000 byar från att rösta.