Han har möblerat om i toppskiktet på landets säkerhetsmyndigheter och har sett till att den korruptionsdömde ex-presidenten Almazbek Atambajev har gripits igen.
Atambajev är en av den nuvarande presidentens främsta motståndare. Han fritogs av demonstranter för bara några dagar sedan men sitter nu återigen inlåst sedan specialstyrkor stormat hans hem, uppger hans talesperson.
Parlamentet har samtidigt formellt utsett Sadyr Japarov till premiärminister i ett försök att forma en ny regering och sätta stopp för maktvakuumet i landet. Kirgizistan har saknat tydlig politisk ledning efter det att landet kastats in i kaos efter det omtvistade parlamentsvalet den 4 oktober.