Enligt Amnesty, vars rapport publicerades på måndagen, handlar det om motsättningar mellan olika folkgrupper och samhällen. Många av de döda har fallit offer för rena banditer, som varit ute för att sprida skräck och stjäla boskap, skriver människorättsorganisationen.
Materialet bygger på omfattande intervjuer i sju delstater, där återkommande farhågor rör väpnade attacker och kidnappningar.
– Misslyckandet från säkerhetsstyrkors sida att skydda bybor från dessa förutsägbara attacker är en skam, säger Osai Ojigho från Amnesty International Nigeria.
De flesta attacker sker utan ideologiska motiv, och bedömare varnar för att koppla våldet till islamistiska extremistgrupper.