Regeringen meddelar att dess väpnade styrkor intog flygbasen omkring 14 mil sydväst om huvudstaden på måndagen.
Övertagandet sker efter en flera veckor lång belägring av basen, där Haftar placerat ut bombflyg.
Haftars styrkor har inte bekräftat uppgifterna, men bilder från nyhetsbyrån AFP:s fotograf visar GNA-styrkor inne på basens område.
Libyen har präglats av regelrätta strider och våld mellan olika falanger sedan den tidigare diktatorn Muammar Gaddafi störtades 2011. Under de senaste åren har GNA och Khalifa Haftar kämpat om makten över landet. Konflikten försvåras av att Haftar stöds av bland andra Ryssland och Förenade arabemiraten, samtidigt som GNA får stöd av Turkiet.