Träbåten förliste av okänd anledning på fredagen utanför Sabratha i landets västra del. Staden är en vanlig avreseplats för migranter som, i flykt från krig och fattigdom, ger sig ut på den farliga resan över Medelhavet till Europa.
Enligt IOM har sex kroppar bärgats, medan 29 människor fortfarande saknas och befaras döda.
Händelsen är den senaste i raden den här månaden. Bara den senaste veckan befaras minst 53 personer ha mist livet utanför Libyens kust. Tidigare i april omkom över 90 personer som färdades på en överfull båt, enligt Läkare utan gränser.