Han ställs därmed mot den forne diktatorn Muammar Gaddafis son Sayf al-Islam.
– Jag meddelar min kandidatur, inte av makthunger, utan för att jag vill leda vårt folk till ära, framsteg och framgång, säger Haftar i ett tv-tal.
Haftar har sedan flera år tillbaka etablerat ett styre i östra Libyen, som konkurrerat med en skakig regering i huvudstaden Tripoli. I västra Libyen beskrivs han som ökänd, efter en brutal militäroffensiv som Haftar inledde 2019.
Häromdagen meddelade även Sayf al-Islam att han ställer upp i valet. Han anklagas av Internationella brottsdomstolen (ICC) för krigsbrott. Sayf al-Islam är näst äldste son till Gaddafi, som störtades och dödades 2011.